По умолчанию уровень ведения журналов (eventlog) для службы MSExchangeDSAccess установлен в None. При этом в журнал записываются только критические события. Я рекомендую установить уровень ведения журналов для категории Topology в Minimum.
Это приведет к тому, что каждые 15 минут в журнале приложений будет появляться событие под номером 2080. Там вы увидите, какие глобальные каталоги и контроллеры домена (GC и DC) использует Exchange сервер, а какие - нет. А главное, проанализировав это сообщение, будет понятно, почему это так происходит.
Это особенно полезно если вы только что установили Exchange сервер в топологию с несколькими доменами или сайтами - в этом случае не помешает проверить ваши предположения о том, какие контроллеры домена выбрал и использует Exchange.
Да и в стабильной топологии полезно иметь такие события каждые 15 минут - если что-то вдруг перестанет работать или станет работать плохо, можно по истории этих событий попытаться восстановить картину происходящего. В Exchange 2007 по умолчанию категория Topology имеет уровень Minimum. Что и рекомендую сделать в Exchange 2000 и 2003.